Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms