Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFAF3Q9BU61 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms