Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TINF2Q9BSI4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms