Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms