Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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