Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms