Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC3Q96B67 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms