Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms