Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms