Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms