Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms