Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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