Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SV2AQ7L0J3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms