Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms