Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms