Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL17Q6UXB2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms