Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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KRT80Q6KB66 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KRT80Q6KB66 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT80Q6KB66 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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