Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ETFRF1Q6IPR1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms