Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms