Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPRC1Q5VV67 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms