Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRRT3Q5FWE3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms