Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms