Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms