Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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