Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms