Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms