Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms