Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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