Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms