Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms