Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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