Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms