Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms