Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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