Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms