Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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