Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms