Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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