Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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