Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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DNASE1L3Q13609 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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