Protein–RNA interactions for Protein: Q13588

GRAP, GRB2-related adapter protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAPQ13588 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAPQ13588 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms