Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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