Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms