Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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