Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms