Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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