Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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KCNH2Q12809 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNH2Q12809 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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