Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms