Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms