Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms